El Comité Ejecutivo es el órgano permanente de gobierno, gestión, administración y dirección de la Confederación de Empresarios de Málaga y asiste a su presidente. Está compuesto por el presidente de CEM, los vicepresidentes, el tesorero, el contador, el secretario y los vocales que la Junta Directiva determine.
La Junta Directiva es el órgano colegiado responsable del funcionamiento de la Confederación. Está compuesta por el presidente de CEM, los vicepresidentes, el tesorero, el contador y la secretaria general.
Asimismo, se integra un representante designado por cada organización miembro de la Confederación y aquellas otras personas que la propia Junta Directiva determine. Igualmente, forman parte de la Junta Directiva las empresas asociadas miembros de pleno derecho.
La Asamblea General es el órgano supremo de gobierno y decisión de CEM y sus acuerdos son de obligado cumplimiento para todos los asociados. Está formada por los representantes de sus miembros asociados.
